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时间短且速度快

微波利用其选择透射作用，使食品内外均匀，迅速升温杀灭细菌。处理时间大大缩短。在强功率密度强度下，仅仅需要几秒或几十秒即能达到效果。

低温杀菌可保证食品质量

微波热效应的快速升温和非热效应的升华作用，增强了杀菌功能。相比常规热力杀菌在较低温度、较短的时间内就能获得效果，一般杀菌温度在75~80℃，处理时间大概3~5分钟。微波特有的加工方式能保留更多的有效成分，保持原有的色、香、味、形等特征。

杀菌彻底

常规热力杀菌是从物料表面开始，通过热传导，由表及里渐次加热，这样存在一定的漏洞。而微波的穿透性使表面与内部同时受热，并且热效应和非热效应的共同作用，杀菌效果更好。 食品成分对微波具有选择吸收性

用微波干燥谷物，由于谷物的主要成分淀粉、蛋白质等对微波的吸收率比较小，谷物本身升温较慢。但谷物中的害虫及问生物一般含水分较多，某些介质易吸收微波能，可使内部升温而杀死。这样，既能达到杀菌效果，又可以保持谷物原有的营养成分。

效率高，节约能源，操控方便

微波可直接使食品内部介质分子产生热效应，装置本身不被加热，也不需要传热的媒介。因此，能量损失少，效率又比普通的杀菌方法高。另外，微波杀菌设备制成隧道式使得生产过程实现自动化，减轻劳动强度并有利于标准化生产。